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更新時間:2025-09-18
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蛋白質(zhì)的泛素化修飾在真核細(xì)胞的生命進(jìn)程中扮演核心角色。Cullin-RING E3泛素連接酶(CRLs)作為泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)中的關(guān)鍵組成部分,是哺乳動物細(xì)胞內(nèi)最大的E3酶家族,負(fù)責(zé)特異性識別、泛素化并降解底物蛋白,從而精密調(diào)控多種生理過程。CRL3作為其中一類重要亞型,特異性地利用BTB結(jié)構(gòu)域蛋白作為底物適配子。人類基因組編碼超過180種BTB蛋白,CRL3復(fù)合物廣泛參與糖脂代謝、癌癥發(fā)生、細(xì)胞周期及發(fā)育等重要生物學(xué)事件。然而,由于CRL3結(jié)構(gòu)復(fù)雜,其分子架構(gòu)與催化機制仍存在大量未知。
2024年2月8日,復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院孫蕾研究員、陳振國研究員團隊與美國德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心Bruce Beutler院士合作,在《Nature Structural & Molecular Biology》上發(fā)表了題為“Dynamic molecular architecture and substrate recruitment of cullin3–RING E3 ligase CRL3KBTBD2"的研究論文。該研究以CRL3KBTBD2對p85α的特異性招募為模型,系統(tǒng)解析了該E3連接酶在催化循環(huán)中的動態(tài)結(jié)構(gòu)變化與功能機制。

p85α是PI3Kα復(fù)合物的調(diào)節(jié)亞基,與催化亞基p110α共同調(diào)節(jié)胰島素信號傳導(dǎo)。KBTBD2作為新發(fā)現(xiàn)的p85α調(diào)控蛋白,在小鼠模型中其缺失會導(dǎo)致p85α累積,引發(fā)胰島素信號紊亂,表現(xiàn)為發(fā)育遲緩、胰島素抵抗、Ⅱ型糖尿病等表型,甚至導(dǎo)致死亡。研究表明,KBTBD2與CUL3及RBX1組裝成CRL3 KBTBD3復(fù)合體,催化p85α的泛素化與降解,從而在代謝穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。
2. CRL3 KBTBD2的催化循環(huán)涉及哪些動態(tài)結(jié)構(gòu)狀態(tài)?
本研究成功解析了CRL3 KBTBD2在多個功能狀態(tài)下的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu),包括自組裝、底物招募(與p85α結(jié)合)、活化(NEDD8修飾)、去活化(與CSN結(jié)合)及底物受體交換(與CAND1結(jié)合)等七種狀態(tài),構(gòu)建了迄今為止最完整的CRL3催化循環(huán)模型。

值得注意的是,KBTBD2本身具有二聚化能力,使得CRL3 KBTBD2可形成四聚、六聚甚至八聚體的高級結(jié)構(gòu),其酶活中心在未結(jié)合底物時處于遮蔽狀態(tài)。而在與p85α、NEDD8或CSN等因子結(jié)合后,復(fù)合體逐步解離為活性二聚體形式,暴露出底物結(jié)合及催化位點。
3.CRL3如何特異性識別并招募全長底物蛋白?
闡明CRLs家族對底物的識別機制一直面臨巨大挑戰(zhàn)。該研究系統(tǒng)性揭示了CRL3 KBTBD2與全長p85α蛋白的互作模式:KBTBD2通過其BTB-BACK與Kelch結(jié)構(gòu)域協(xié)同作用,與p85α形成多界面結(jié)合,為底物識別提供高親和力與特異性。該工作彌補了CRLs招募全長底物的結(jié)構(gòu)機制空白,為理解E3連接酶的底物選擇性提供了新視角。
本研究提出CRL3KBTBD2在催化循環(huán)中的動態(tài)構(gòu)象變化模型,系統(tǒng)闡釋了其通過結(jié)構(gòu)重組實現(xiàn)底物招募與泛素化的機制。這不僅深化了對CRL3功能的理解,也為針對CRLs的藥物開發(fā)提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
值得關(guān)注的是,同期《Nature Structural & Molecular Biology》推出了“泛素化"專題,發(fā)表了多篇相關(guān)研究及評論,反映出該領(lǐng)域在機制探索與臨床應(yīng)用方面的持續(xù)活躍與重要性。

結(jié)語
泛素-蛋白酶體系統(tǒng)在維持蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)和細(xì)胞功能中發(fā)揮核心作用,其失調(diào)與多種重大疾病密切相關(guān)。目前,以該系統(tǒng)為靶點的藥物研發(fā)已在腫瘤治療中取得實質(zhì)性進(jìn)展,包括蛋白酶體抑制劑、去泛素化酶抑制劑和泛素化酶調(diào)節(jié)劑等多類化合物。未來研究將繼續(xù)深化對該系統(tǒng)調(diào)控機制的理解,推動更具選擇性和高效性的治療策略的開發(fā)。

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